Die Massenspektrometrie (MS) ist eine Art der Analyse, die verwendet wird, um zu bestimmen, aus welchen Molekülen eine Probe besteht, basierend auf dem Massenspektrum, das von den Ionen erzeugt wird. Massenspektrometer sind in der Lage, die traditionelle Identifizierung und Quantifizierung von Zielanalyten durchzuführen; sie können jedoch auch in einer klinischen Umgebung zur schnellen Identifizierung von Bakterien eingesetzt werden. Der Erreger einer Sepsis ändert sich im Laufe der Zeit, und klinische Entscheidungen, die das Management von Infektionen betreffen, basieren oft auf den Ergebnissen der Bakterienidentifikation. Daher ist es wichtig, dass solche Identifizierungen schnell durchgeführt und korrekt interpretiert werden. Das MALDI-TOF-Massenspektrometer (Matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight) ist eines der beliebtesten MS-Instrumente in der Biologie, da es eine schnelle und präzise Identifizierung von Gattung und Spezies eines umfangreichen Spektrums von gramnegativen und -positiven Bakterien ermöglicht. Die Identifizierung von Mikroorganismen mit Hilfe der Massenspektrometrie basiert auf der Identifizierung eines charakteristischen Spektrums jeder Spezies, das dann mit einer großen Datenbank im Gerät abgeglichen wird. Die vorliegende Übersichtsarbeit gibt eine aktuelle Perspektive auf die Herausforderungen und Möglichkeiten der bakteriellen Identifizierung sowie einen schriftlichen Bericht darüber, wie technologische Innovationen die MS vorangebracht haben. Auch zukünftige klinische Anwendungen werden angesprochen, insbesondere der Einsatz von MALDI-TOF MS im Bereich der Mikrobiologie zur Identifizierung und Analyse von Antibiotikaresistenzen.