Fondée en 1886 par le pasteur John Andrew Parker, un affranchi, l’église baptiste Ebenezer d’Atlanta, Géorgie ne comptait que 13 membres et aucun bâtiment d’église au décès de Parker en 1894 et lorsque Alfred Daniel Williams devint son deuxième pasteur. Les sermons puissants de Williams et ses solides compétences en matière de leadership ont fait passer le nombre de fidèles à 750 en 1913. Inspiré par le désir de toute une vie de prêcher la parole de Dieu et par une expérience de conversion, le dévouement de Williams lui permet d’obtenir un terrain à l’angle d’Auburn Avenue et de Jackson Street à Atlanta et de réunir 25 000 dollars pour un bâtiment comprenant un auditorium et une galerie pouvant accueillir 1 250 personnes. L’église entame la construction du nouveau bâtiment en mars 1914. Au décès du pasteur Williams en 1931, le révérend Martin Luther King, Sr, époux d’Alberta, la fille du pasteur Williams, a assumé le manteau de la direction d’Ebenezer.
Le pasteur King a dirigé l’église tandis que sa femme, Alberta Williams King, a dirigé le ministère de la musique. Leur fils, Martin, Jr, a grandi dans cet environnement chrétien nourricier. Il a prêché son premier sermon à l’église en 1948, à l’âge de 19 ans, et a été ordonné ministre peu après. Certains des sermons les plus durables du Dr Martin Luther King, Jr ont été prononcés à Ebenezer, parmi lesquels »Les dimensions d’une vie complète », »Qu’est-ce que l’homme ? » et »Aimer ses ennemis ».
Lorsque le jeune King a terminé ses études de doctorat à l’école de théologie de l’université de Boston (Massachusetts) en 1954, il a accepté un pastorat à l’église baptiste de Dexter Avenue à Montgomery, en Alabama. Les membres de l’église baptiste Ebenezer assistent en grand nombre à son service d’installation. Il rejoint son père à Ebenezer en tant que co-pasteur et exerce ses fonctions de 1960 à 1968, date à laquelle il est assassiné. Son frère, A. D. Williams King, a occupé le poste de co-pasteur après l’assassinat. « Daddy » King, comme était surnommé le révérend Martin Luther King, Sr, a continué à exercer cette fonction jusqu’à son décès en 1975.
En 1980, le Martin Luther King, Jr, National Historic Site a été créé. Le site est composé de plusieurs bâtiments situés autour de la maison de King sur Auburn Avenue dans le quartier historique de Sweet Auburn à Atlanta. Parmi ces structures, l’édifice original de l’église baptiste Ebenezer figure en bonne place en tant que site patrimonial et joue un rôle important dans l’exploration de la vie et des réalisations de Martin Luther King. Le site s’étend sur 35 acres. Il y a un centre d’accueil avec un musée sur le mouvement américain des droits civiques qui illustre le chemin suivi par le Dr Martin Luther King, Jr. Il y a une roseraie internationale pour la paix mondiale « I Have a Dream » et un mémorial en l’honneur de Mohandas K. Gandhi. Le « International Civil Rights Walk of Fame » rend hommage à ceux dont les sacrifices ont contribué à faire de l’égalité une réalité pour tous. Le centre est un point central lors des événements de la journée Martin Luther King, Jr, et des célébrations du mois de l’histoire des Noirs.
Aujourd’hui, Ebenezer Baptist, avec une congrégation de 6 000 personnes, continue de servir la communauté d’Atlanta depuis ses nouvelles installations dans le site historique King, sous la direction du révérend Dr Raphael G. Warnock. Raphael G. Warnock était auparavant le pasteur adjoint de l’Abyssinian Baptist Church de New York et le pasteur principal de la Douglas Memorial Community Church de Baltimore, dans le Maryland. Il n’est que le cinquième ministre à diriger la congrégation d’Ebenezer et il occupe cette fonction depuis 2005.