Des inquiétudes ont été soulevées quant à la provenance des corps et à l’éthique de la visualisation de restes humains (notamment par les catholiques), pour les enfants. Dans un éditorial, le révérend luthérien Christoph Reiners s’est interrogé sur l’effet sur les valeurs des enfants. Avant la première américaine de 2005, le procureur général de Floride a exprimé l’avis que l’approbation du State Anatomical Board devrait être requise. Le Conseil s’est opposé à l’exposition de Tampa, son directeur estimant que l’exposition devait être fermée. Les responsables de Premier Exhibitions n’étaient pas d’accord, affirmant que le Conseil n’avait compétence que sur les écoles de médecine et non sur les musées ; l’exposition a ouvert deux jours avant la date prévue au Musée des sciences et de l’industrie de Tampa.
Dès 2006, le New York Times et l’émission de télévision 20/20 ont publié des reportages sur un « marché noir » de cadavres et d’organes chinois, suscitant une enquête du Congrès, une enquête du gouverneur de NY Andrew Cuomo et la démission du PDG de Premier, Arnie Geller. À la suite de l’enquête de M. Cuomo et de l’accord conclu en 2008, la page d’accueil du site web de l’exposition affiche un avertissement concernant l’origine présumée des corps et des fœtus, indiquant que l’exposition « s’appuie uniquement sur les déclarations de ses partenaires chinois » et « ne peut pas vérifier de manière indépendante » que les corps n’appartiennent pas à des prisonniers exécutés. Le militant des droits de l’homme Harry Wu et le directeur du groupe de défense des droits de l’homme en Chine se sont tous deux opposés à l’exposition pour ces motifs.
Une coordinatrice de l’éducation scientifique au Carnegie Museum of Science a démissionné de son poste à cause de l’exposition, invoquant ses croyances religieuses, des questions sur la provenance et une répugnance générale à exposer des « restes humains ». Le professeur Anita Allen, bioéthicienne à l’université de Pennsylvanie, a fait valoir que dépenser de l’argent pour « s’extasier » devant des restes humains devrait susciter de sérieuses inquiétudes. Thomas Hibbs, éthicien à l’université Baylor, compare les expositions de cadavres à la pornographie dans la mesure où elles réduisent le sujet à « la manipulation de parties du corps dépouillées de toute signification humaine plus large ». Même si le consentement était obtenu, le rabbin Danny Schiff soutient que nous devrions toujours nous interroger sur ce que le fait de fournir « des corps disposés dans des vitrines pour un public affamé » dit d’une société.
En 2017, en République tchèque, pendant la durée de l’exposition Body The Exhibition qui se déroule à Prague au parc des expositions de Holesovice, quatre médecins et quatre organisations à but non lucratif ont publié une déclaration sur les problèmes d’éthique et de droits de l’homme. La déclaration demande aux organisateurs de présenter le consentement des donateurs des corps exposés, si un tel document existe. Elle s’inquiète également de la possibilité que les corps proviennent de prisonniers d’opinion en Chine. La police locale de Prague a rejeté une proposition d’interdiction de l’exposition et d’enterrement des corps, proposée par le maire du district de Prague 7, Jan Cizinsky, qui a également lancé un appel à l’ambassade de Chine, demandant d’enterrer les corps.