Dans la taxonomie biologique, un domaine (également superregnum, superkingdom ou empire) est un taxon du rang le plus élevé des organismes, supérieur à un royaume.
Le domaine (ou ses synonymes) est le plus inclusif de ces groupements biologiques. La disposition des taxons reflète les différences évolutives fondamentales des génomes. Il existe plusieurs classifications alternatives modernes de la vie par domaine. Parmi elles, on trouve :
- Le système à » deux empires « , avec des groupements de premier niveau des empires Prokaryota (ou Monera) et Eukaryota.
- Le système à six domaines avec des groupements de premier niveau des Protista, Archaebacteria, Eubacteria, Fungi, Plantae et Animalia.
- Le système à trois domaines de Carl Woese, introduit en 1990, avec des groupements de premier niveau des domaines Archaea, Bacteria, et Eukaryota.
Après avoir défini Archaea comme un nouveau domaine, Woese a redessiné l’arbre taxonomique. Son système à trois domaines est basé sur les relations génétiques. Il divise la vie en 23 divisions principales dans trois domaines : Bactéries, Archaea, et Eukarya. Les archées ne sont ni des bactéries ni des eucaryotes. Vu sous un autre angle, ce sont des procaryotes qui ne sont pas des bactéries.
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