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Les micro-organismes sont des organismes unicellulaires que l’on trouve dans quatre règnes : le règne végétal, les bactéries, les champignons et les protozoaires. S’il peut sembler au premier abord que tous les micro-organismes sont identiques, ils constituent en fait peut-être le groupe d’organismes le plus diversifié au monde, leur taille minuscule étant l’une des rares choses qu’ils partagent entre eux.

Ces micro-organismes sont à la base même des réseaux alimentaires et des fonctions écologiques ; sans eux, la vie ne serait tout simplement pas possible. Qu’il s’agisse de générer de l’oxygène, de faciliter la décomposition, de favoriser le cycle du carbone ou de libérer des nutriments qui, autrement, seraient liés à la nature et ne seraient pas disponibles pour le reste d’entre nous, les êtres vivants, le monde tel que nous le connaissons aujourd’hui n’existerait tout simplement pas sans les micro-organismes et les bactéries.

Dans les étangs, les types de bactéries et de micro-organismes présents diffèrent selon le type de plan d’eau – de manière peut-être prévisible, les étangs naturels contiennent une plus grande diversité de ces organismes bénéfiques que la plupart des étangs artificiels.

Types de bactéries d’étang & Micro-organismes

Il existe plusieurs milliers de types de bactéries et de micro-organismes présents dans les écosystèmes aquatiques, y compris dans votre étang personnel. Les principaux groupes aquatiques comprennent les arthropodes, les bactéries, les protozoaires, les hydres, les champignons, le phytoplancton et les algues :

Les arthropodes comprennent des micro et macroinvertébrés tels que les tardigrades (oursons d’eau), les crustacés, certaines larves d’insectes et les acariens d’eau, entre autres, et la plupart sont visibles sans l’utilisation d’un microscope. Ces organismes uniques et variés remplissent diverses fonctions : ils servent de nourriture à d’autres créatures, comme les poissons, ils aèrent le sol, ils consomment d’autres micro-organismes, comme les algues, et des créatures potentiellement problématiques comme les larves de moustiques (bien que les larves de moustiques soient elles-mêmes considérées comme des arthropodes) et ils décomposent la matière organique. La taille de ces créatures varie vraiment, de la taille du point à la fin de cette phrase à celle d’un grand papillon monarque (oui, ce sont aussi des arthropodes !). Dans les étangs artificiels, la présence de certains d’entre eux est une bonne chose, tandis que d’autres peuvent indiquer une mauvaise qualité de l’eau. Par exemple, les tardigrades se trouvent dans pratiquement tous les endroits humides, que ce soit dans la mousse, une flaque d’eau ou votre étang. Ils sont importants pour le bon fonctionnement de l’écosystème, et votre bassin devrait certainement en avoir. D’autres, comme les larves de moustiques, pourraient signifier que votre bassin est trop stagnant et que la qualité de votre eau doit être surveillée de près et ajustée.

Comme vous le savez probablement, il existe de bonnes et de mauvaises bactéries. Bien que ce groupe ait souvent mauvaise réputation, les écosystèmes et les organismes qui les composent (y compris nous !) mourraient sans elles. Elles comptent parmi les micro-organismes les plus petits et les plus anciens de la planète et se trouvent pratiquement partout, de la plus petite goutte de pluie au capuchon d’un stylo à encre. Ils sont capables de se multiplier très rapidement, ce qui les rend exceptionnels pour aider à la décomposition dans les écosystèmes et ainsi assurer le cycle des nutriments. Plus précisément, il existe des bactéries hétérotrophes et des bactéries autotrophes. Les premières sont celles qui sont responsables de la décomposition et du cycle des nutriments (et peuvent également aider à contrôler les populations d’algues en réduisant les nutriments qui leur sont disponibles), tandis que les secondes sont généralement connues sous le nom de cyanobactéries (souvent appelées à tort algues bleu-vert même si elles ne sont pas réellement des algues).

Les cyanobactéries sont délicates – vous en voulez dans votre bassin, mais pas trop. Les cyanobactéries ont développé une relation symbiotique avec certaines espèces d’algues et de champignons (et en fait, les chloroplastes des plantes ont évolué à partir des cyanobactéries il y a longtemps, nous devons donc les remercier pour beaucoup de choses !), et sont responsables de la fixation de l’azote afin qu’il soit disponible pour d’autres organismes à utiliser. Cependant, une trop grande quantité de cyanobactéries indique une mauvaise qualité de l’eau et est le plus souvent le coupable derrière une eau verte et malodorante, vous devrez donc vous assurer de surveiller quotidiennement la qualité de votre eau.

Les protozoaires sont des organismes unicellulaires microscopiques qui ressemblent aux animaux en ce sens qu’ils doivent consommer d’autres organismes afin d’obtenir les nutriments dont ils ont besoin pour vivre. Par exemple, les bactéries aident à décomposer la matière organique, et les protozoaires se nourrissent à leur tour des bactéries et des détritus (et sont à leur tour mangés par le zooplancton, qui est à son tour consommé par les invertébrés, qui sont à leur tour dévorés par les poissons, et ainsi de suite). Sans les protozoaires (qui consomment jusqu’à 50 % des bactéries), les bactéries pourraient s’accumuler jusqu’à des niveaux potentiellement dangereux, et également sans les protozoaires, un maillon excessivement critique du réseau alimentaire serait supprimé, ce qui paralyserait gravement l’écosystème dans son ensemble et limiterait les plantes et les animaux qui pourraient y survivre.

Les protistes (ou protozoaires) sont de petites créatures assez fascinantes – ils ne sont ni des plantes ni des animaux, mais appartiennent plutôt à un groupe entièrement à part, avec plus de 50 000 espèces estimées. Parmi les espèces courantes que l’on trouve dans les bassins, citons Euglena, Paramecium, les amibes et les ciliés. La plupart des protozoaires sont considérés comme bénéfiques, ils remplissent les fonctions mentionnées ci-dessus et sont également connus pour créer ce qu’on appelle un biofilm, qui est essentiellement une couche visqueuse pouvant contenir des protozoaires, des bactéries et/ou des champignons et dont se nourrissent divers organismes. D’autres (environ un tiers des espèces de protozoaires) sont toutefois parasites et peuvent provoquer des maladies telles que la giardia. Dans l’ensemble, cependant, la présence de protozoaires dans votre bassin est une chose très bonne et nécessaire – sans eux, l’écosystème de votre bassin aurait beaucoup de mal à fonctionner.

Les hydraires sont des micro-organismes prédateurs d’eau douce, techniquement considérés comme des animaux, qui se trouvent principalement dans les étangs, les lacs et autres plans d’eau à faible courant. Ils se nourrissent d’une variété de créatures, bien que principalement de larves d’insectes et de petits crustacés, et, fait intéressant, ne sont pas connus pour mourir de vieillesse, mais plutôt seulement par blessure, maladie, famine, ou être mangés. Ils ont des tentacules extrêmement minuscules et se fixent aux rochers, aux rondins et à la végétation aquatique, où ils se nourrissent de tout ce qui flotte près d’eux ou se trouve également sur cette surface. Elles sont présentes dans la plupart des étangs, et ne sont pas vraiment considérées comme bonnes ou mauvaises. Certaines espèces d’hydra ont développé une relation mutualiste avec les algues – l’hydre se nourrit de choses qui autrement prédateraient sur les algues, tandis que les algues produisent des composés photosynthétiques qui peuvent être utilisés comme source de nourriture par l’hydre.

5) Les champignons

Parce que les champignons sont généralement si faciles à voir et relativement grands, il peut être étrange de les considérer comme des micro-organismes. Cependant, les champignons sont en effet des organismes unicellulaires qui commencent par être assez petits, et peuvent également exister dans de petits filaments appelés hyphes (qui ont souvent une relation mutualiste avec les racines des plantes – ils aident la plante à obtenir des nutriments du sol, et les racines en retour dégagent des composés qui peuvent être utilisés par les champignons).

Les champignons sont hétérotrophes et libèrent des enzymes dans le milieu environnant qui décomposent les composés et les nutriments en formes utilisables par les champignons et d’autres organismes. Grâce à cela, ils contribuent au cycle des nutriments, à la décomposition et fournissent une source de nourriture précieuse à d’autres organismes. En fait, les champignons sont l’un des seuls organismes capables de décomposer des composés structurels végétaux résistants tels que la lignine, les tanins et la cellulose, et jouent donc un rôle crucial dans la décomposition des matières végétales aquatiques. Grâce à cela, ils aident à prévenir l’accumulation de nutriments dans votre bassin, favorisant ainsi une qualité d’eau saine.

Le phytoplancton est une plante flottante et microscopique qui préfère les eaux calmes, comme celles des étangs ou des grands fonds. Dans les cours d’eau et les rivières, il n’y a que peu ou pas de phytoplancton car les eaux plus rapides les emportent plus vite qu’elles ne peuvent se reproduire. Ce sont des organismes unicellulaires qui se regroupent souvent en colonies pour survivre et constituent une source de nourriture essentielle pour le zooplancton, les invertébrés aquatiques et certaines espèces de poissons. Cependant, les algues aiment le phytoplancton, et donc si le nombre de phytoplancton est élevé, le nombre d’algues est également susceptible d’être élevé et de conduire à une prolifération d’algues. Vous pouvez aider à contrôler leur nombre en incorporant un peu plus de débit dans votre bassin, via un aérateur, une pompe ou une cascade, même si vous ne voudrez pas perturber l’eau au point de les éliminer complètement.

Peut-être l’organisme le plus connu des propriétaires de bassins, les algues peuvent être microscopiques ou se rassembler pour former de grandes colonies. Les algues sont exceptionnellement importantes dans les écosystèmes des bassins, car elles sont à la base du réseau alimentaire – elles sont consommées par les insectes, qui sont à leur tour consommés par les poissons, les oiseaux, les herpès et divers mammifères. Certains animaux mangent aussi directement les algues. En outre, les algues génèrent de l’oxygène et aident au cycle des nutriments – ce n’est que lorsque leur nombre devient incontrôlable que les algues deviennent un problème, comme nous l’expliquons dans notre article sur les différents types d’algues que l’on trouve dans les étangs.

Le nombre d’espèces d’algues est largement contesté, allant d’estimations de 1 million à 350 millions. Bien sûr, certaines algues sont utiles tandis que d’autres ont tendance à être plus nuisibles. Les diatomées, par exemple, ne sont jamais mauvaises, peu importe leur nombre. En fait, elles sont responsables de la production de 25 à 40 % de l’oxygène mondial (plus que toutes les forêts tropicales combinées) et ne ressemblent pas du tout à des algues typiques. Elles ressemblent plutôt à de minuscules structures ressemblant à du verre avec des motifs complexes.

D’autres espèces, comme l’euglena, sont plus problématiques car vous ne saurez même pas qu’elles sont là jusqu’à ce qu’une efflorescence se produise, transformant votre bassin en rouge vif et endommageant gravement la qualité de l’eau jusqu’à ce que vous puissiez maîtriser la population – ce qui n’est pas une mince affaire étant donné que l’euglena ne répond à aucune méthode de contrôle biologique ou manuel connue. Comme toujours, surveillez régulièrement la qualité de votre eau et vous minimiserez grandement le risque que les algues (ou n’importe lequel des micro-organismes abordés ici) deviennent problématiques.