ヒトの免疫系（およびほとんどの哺乳類の免疫系）は、物理的なバリア（皮膚や粘液）、自然免疫細胞と適応細胞、化学的なメッセンジャー（サイトカイン）、一次および二次リンパ組織で構成されています。
一次リンパ組織には、骨髄と胸腺があります。 免疫細胞の前駆体は、赤血球や血小板と一緒に骨髄で発生します（図1）。 骨髄は赤血球と黄血球に分けられる。 赤髄は白血球の前駆細胞の発生とB細胞の分化の場である。
T細胞の前駆体は、もう一つの主要なリンパ系器官である胸腺に移動します。 胸腺は心臓の前側にある小さな臓器です。 胸腺は、T細胞の教育、一次寛容の誘導、および分化の場である。 胸腺は、出生後から思春期前まで最も活発に活動し、その後、徐々に小さくなって活動しなくなります（胸腺退縮）。
胸腺ではT細胞が分化し、成熟して病原体に反応するために全身に運ばれます。
二次リンパ系器官には、脾臓、パイエル板、リンパ節、扁桃、アデノイドなどがあります。 一次器官と二次器官の間の移動は、循環系とリンパ系を介して行われます。
脾臓は、B細胞とT細胞の相互作用、B細胞の成熟、適応免疫反応の増幅の重要な場所です。
パイエル板は、消化器系全体に存在する特殊なリンパ組織です。
パイエル板は消化器系全体に存在する特殊なリンパ組織で、腸内細菌のサンプリングやモニタリングに重要な役割を果たしています。
リンパ節は、体中に分布する小さなカプセル状の器官です。 リンパは体の各部位から局所リンパ節を通って排出されます。 リンパ節内には、抗原提示細胞や免疫細胞が常駐しており、これらの細胞は感染によって生じるシグナルを認識し、増幅することができます。 感染症や自己免疫疾患、癌などの病的な状態になると、リンパ節は腫れて硬くなり、圧迫されます。
扁桃腺とアデノイドは喉にあり、摂取した病原体や呼吸器系の病原体に対する第一の防御ラインとなっています。 扁桃腺の表面にある特殊な抗原捕獲細胞であるM細胞は、病原体から抗原を「つかみ」、扁桃腺に存在するB細胞やT細胞に提示します。 B細胞は、抗原に反応して成熟・増殖し、感染症に対抗します。