排尿痛は、尿路感染症（UTI）によく見られる症状です。 尿路結石は、細菌感染の結果として起こります。
尿道、膀胱、尿管、腎臓が尿路を構成していますが、尿路の炎症が原因の場合もあります。 尿管とは、腎臓から膀胱へ尿を運ぶ管のことです。
Mayo Clinicによると、女性は男性よりも尿路感染症にかかりやすいそうです。 これは、男性に比べて尿道が小さいためです。 尿道が短いと、細菌が膀胱に到達するまでの距離が短くなります。
その他の疾患でも、男女ともに排尿痛が起こることがあります。
男性は前立腺炎が原因で排尿痛が起こることがあります。 この症状は、前立腺の炎症です。
また、性感染症（STI）にかかっている場合も、排尿時に痛みを感じることがあります。 排尿痛の原因となるSTIには、性器ヘルペス、淋病、クラミジアなどがあります。 特に、これらの感染症は症状が出ないことも多いので、検査を受けることが大切です。
コンドームなしでのセックスや複数のパートナーとのセックスなど、特定の性行為はSTIに感染するリスクが高くなります。
排尿痛のもう一つの原因は、膀胱炎、つまり膀胱内膜の炎症です。 間質性膀胱炎（IC）は、痛みを伴う膀胱症候群としても知られています。
ICの症状としては、膀胱や骨盤内の痛みや圧迫感がありますが、これは最も一般的な膀胱炎です。 米国国立糖尿病・消化器・腎臓疾患研究所（NIDDK）によると、医師はICの原因を把握していません。
場合によっては、放射線治療によって膀胱の痛みや排尿痛が生じることもあります。
腎臓結石があると、快適な排尿ができないことがあります。
排尿痛は、感染症が原因ではない場合もありますが、その場合は、腎臓の中にある硬い物質の塊です。 また、性器に使用する製品が原因となることもあります。 石鹸、ローション、バブルバスは膣組織を刺激します。 また、洗濯用洗剤やその他のトイレタリー製品に含まれる染料も、炎症や排尿痛の原因となります。