1886年に自由民であったジョン・アンドリュー・パーカー牧師によって設立されたジョージア州アトランタのEbenezer Baptist Churchは、1894年にパーカー牧師が亡くなり、アルフレッド・ダニエル・ウィリアムズ氏が2代目の牧師に就任したときには、会員数はわずか13名で教会の建物もありませんでした。 1894年にパーカーが亡くなり、アルフレッド・ダニエル・ウィリアムズが2代目牧師に就任すると、ウィリアムズの力強い説教と強力なリーダーシップにより、1913年には信徒数が750人にまで増加しました。 生涯をかけて神の言葉を伝えたいという思いと、回心の体験に触発されたウィリアムズは、目的達成のために、アトランタのオーバーン・アベニューとジャクソン・ストリートの角に土地を確保し、1,250人を収容できる講堂とギャラリーを備えた建物のために2万5,000ドルを調達しました。 教会は1914年3月に新しい建物の起工式を行いました。 1931年にウィリアムズ牧師が亡くなると、ウィリアムズ牧師の娘であるアルバータさんの夫であるマーティン・ルーサー・キング・シニア牧師がエベネゼル教会の指導者の役割を担いました。
キング牧師は教会を指導し、アルバータ・ウィリアムズ・キング夫人は音楽活動を担当しました。 キング牧師は1948年、19歳のときにこの教会で初めて説教をし、その後すぐに聖職に就いた。
1954年にボストン（マサチューセッツ）大学神学部の博士課程を修了したキング牧師は、アラバマ州モンゴメリーのデクスター・アベニュー・バプティスト教会の牧師に就任した。 彼の就任式には、エベネゼル・バプティスト教会の会員が大勢出席した。 彼は父親と一緒にエベネゼル教会の共同牧師となり、1960年から暗殺される1968年まで務めた。 弟のA.D.ウィリアムズ・キングは、暗殺された後、共同牧師を務めた。 “
1980年には、マーティン・ルーサー・キング・ジュニア・ナショナル・ヒストリックサイトが設立されました。 この史跡は、アトランタの歴史的な地区であるスウィート・オーバーン地区のオーバーン・アベニューにあるキング牧師の家の周辺にあるいくつかの建物で構成されています。 その中でも「エベニーザー・バプティスト教会」の建物は、キング牧師の人生や功績を知る上で重要な遺産となっている。 遺産は35エーカーの敷地にあります。 ビジターセンターには、キング牧師がたどった道を紹介するアメリカ公民権運動博物館があります。 また、”I Have a Dream “国際平和バラ園と、モハンダス・K・ガンジーを記念した記念碑があります。 また、「国際公民権ウォーク・オブ・フェイム」では、すべての人に平等を実現するために犠牲を払った人々を称えています。
現在、6,000人の信徒を擁するエベネゼル・バプティストは、キング史跡内の新しい施設で、ラファエルG.ワーノック牧師の指導のもと、アトランタのコミュニティに貢献しています。 ワーノック牧師は、これまでニューヨークのアビシニアン・バプティスト教会の副牧師、メリーランド州ボルチモアのダグラス・メモリアル・コミュニティ・チャーチの主任牧師を務めてきました。 ワーノック博士は、エベネゼル教会を率いる5人目の牧師であり、2005年からその任に就いています。