ホモプラシーとホモロジーの定義、そして系統分析で使用されるキャラクターステートの中でどのようにホモプラシーとホモロジーを見分けるかについては、多くの議論があります。 多くの人は、私が「過程的アプローチ」と呼んでいるものを提唱しています。これは、遺伝、発生、機能などの情報を先験的に利用して、2つの特徴的な状態を相同性または同質性のあるものとして識別するものです。 しかし、これらの基準で表されるプロセスは、ほとんどの生物とほとんどのキャラクターについて十分に知られていないため、ホモプラスとホモロジーの識別に確実に使用することはできないと私は主張する。 代わりに、確実ではないが、系統樹が相同性の究極のテストとなるべきである。 文字状態が先験的に相同であると仮定されるのは、これが反証可能であるからであり、また、文字状態の分析に最初に含まれるのは、系統発生的に有益であるかもしれないという仮定に基づいているからである。 系統分析で対称形質や共形質として脱落しても、相同性は検証されません。 もし、それらが複数のクレードで独立して進化したホモプラシーとして脱落した場合は、相同性としての地位が偽られ、ホモプラシーが特定されることになる。 文字状態変換シリーズ、機能的形態学、より細かいレベルの形態学的比較、文字の分布と相関関係のすべてが、ある系統におけるホモプラシーの存在を説明するのに役立つ。 これらのホモプラスイを「ノイズ」として無視せずに説明することは、系統分析の目標として、系統図の作成と同じくらい重要である。 中新世のホミノイドの化石記録からの例を挙げて、性格状態の進化を理解するために、プロセス-インフォーム-パターン-認識-事後的アプローチの利点を説明します。