Streptococcus pneumoniae. Często nazywane „pneumokokami”, bakterie te są normalnie obecne w nosie i gardle wielu ludzi, nie powodując żadnych infekcji. Dlatego to zdrowi nosiciele w populacji przenoszą bakterie na osoby starsze, dzieci lub inne podatne osoby, wśród których może dojść do poważnej choroby. W Szwajcarii pneumokoki powodują rocznie około tysiąca poważnych zakażeń (w krwiobiegu lub w postaci zapalenia opon mózgowych) oraz kilka tysięcy przypadków zapalenia płuc. Bakterie te są również odpowiedzialne za wiele samoistnie ustępujących infekcji, w tym zapalenie oskrzeli i ucha.
Staphylococcus aureus jest obecny jako część flory skórnej u około jednej trzeciej populacji ludzkiej, nie wywołując chorób. W zależności od szczepu i układu odpornościowego osoby zakażonej, S. aureus może zakażać skórę, kości i tkanki miękkie wewnątrz organizmu, w tym krwiobieg. W szpitalach jest najczęstszą przyczyną zakażeń pooperacyjnych. W hodowli zwierząt może wywoływać różne infekcje, szczególnie w wymionach krów mlecznych (mastitis).
Escherichia coli jest enterobakterią, która żyje w jelitach ludzi i zwierząt, nie wywołując chorób. Jest ona nawet pożyteczna i stanowi część normalnej flory jelitowej zdrowych osobników. Może jednak powodować infekcje, jeśli dostanie się do innego miejsca w organizmie, np. do dolnych dróg moczowych, jamy brzusznej lub mózgu w przypadku noworodków. Niektóre patogenne szczepy E. coli (np. wytwarzająca toksyny O157:H7) są znane z tego, że przechodzą ze zwierząt na ludzi poprzez produkty spożywcze. U ludzi takie bakterie mogą prowadzić do gorączki, nudności, wymiotów, skurczów żołądka i biegunki, które w niektórych przypadkach mogą być śmiertelne.
Klebsiella pneumoniae to kolejny gatunek enterobakterii powszechnie występujący w przewodzie pokarmowym zdrowych ludzi i zwierząt. Jest jednak jednym z najczęstszych sprawców zakażeń szpitalnych, jak również zakażeń dróg moczowych i oddechowych, zwłaszcza zapalenia płuc. U noworodków Klebsiella pneumoniae może zainfekować krwioobieg, co prowadzi do zwiększonej śmiertelności. Ten typ bakterii ma również zdolność do łatwego nabywania wielu form oporności na antybiotyki.
Warto również wspomnieć o Acinetobacter baumannii i Pseudomonas aeruginosa, które należą do tzw. patogenów szpitalnych, ponieważ wywołują zakażenia głównie w szpitalach i domach opieki. Oporność tych dwóch gatunków bakterii na antybiotyki ostatniej szansy, takie jak karbapenemy i polimyksyny, jest coraz większa, zarówno w skali krajowej, jak i globalnej.
.