W filmie widzimy obsadę i ekipę podróżującą autobusem na izraelską pustynię, w celu odtworzenia Męki Pańskiej. Montują swoje rekwizyty i przebierają się w kostiumy. Jeden z członków grupy, Ted Neeley, jest otoczony przez pozostałych. Zakłada białą szatę i wyłania się jako Jezus („Uwertura”).
Historia zaczyna się od Judasza, który martwi się o popularność Jezusa; zostaje okrzyknięty Synem Bożym, ale Judasz czuje, że zbytnio wierzy we własne przesłanie. Judasz obawia się konsekwencji ich rosnącego ruchu („Heaven on Their Minds”). Inni uczniowie bezskutecznie wypytywali Jezusa o informacje na temat Jego planów na przyszłość („What’s the Buzz?”). Przybywa Judasz, który oświadcza, że Jezus nie powinien zadawać się z taką Marią Magdaleną (historycznie oskarżaną o prostytucję), co burzy nastrój („Dziwna rzecz tajemnicza”). Jezus z gniewem mówi Judaszowi, że powinien zostawić Marię w spokoju, ponieważ jego własne konto nie jest czyste. Następnie Jezus zarzuca wszystkim Apostołom, że nie dbają o Niego. Tej nocy w świątyni Kajfasz obawia się, że lud ukoronuje Jezusa na króla, co Rzymianie wezmą za powstanie. Annasz próbuje rozwiać jego obawy, ale w końcu dostrzega punkt Kajfasza. Annasz sugeruje, aby zwołać radę i wyjaśnić im obawy Kajfasza. Kajfasz zgadza się („Then We Are Decided”). Gdy Jezus i apostołowie udają się na spoczynek, Maria koi go jakąś drogą maścią. Judasz mówi, że takie pieniądze powinny być rozdane ubogim, a nie roztrwonione w ten sposób. Jezus upomina go ponownie… wyjaśniając, że ubodzy będą zawsze, ale On sam już nie („Everything’s Alright”).
Następnego dnia w świątyni jerozolimskiej rada kapłanów omawia swoje obawy związane z Jezusem. Kajfasz mówi im, że jest tylko jedno rozwiązanie: tak jak Jan Chrzciciel, Jezus musi zostać stracony dla dobra narodu („Ten Jezus musi umrzeć”). Gdy Jezus i jego zwolennicy radośnie przybywają do Jerozolimy, Kajfasz nakazuje mu rozwiązać tłum w obawie przed zamieszkami. Jezus odpowiada, że taki gest byłby daremny i zamiast tego przystępuje do pozdrawiania mas („Hosanna”). Później Szymon Zealota i horda innych Zealotów wyrażają swój podziw dla Jezusa („Szymon Zealota”). Chociaż Jezus początkowo docenia to, zaczyna się niepokoić, gdy Szymon sugeruje, by skierować tłum do powstania przeciwko rzymskim okupantom. Jezus ze smutkiem odrzuca tę sugestię, mówiąc, że nie rozumieją Jego prawdziwego celu („Biedna Jerozolima”).
Pontiusz Piłat, rzymski gubernator Judei, ujawnia, że śnił mu się człowiek z Galilei (Jezus) i że będzie obwiniony za śmierć tego człowieka („Sen Piłata”). Jezus i jego zwolennicy przybywają do świątyni, która została opanowana przez handlarzy pieniędzy i prostytutki („Świątynia”). Rozwścieczeni kapłani obserwują z ukrycia, jak ku przerażeniu Judasza, wściekły Jezus niszczy stragany i zmusza sprzedawców do odejścia („Moja świątynia powinna być…”). Wędrując samotnie poza miastem, Jezus zostaje otoczony przez trędowatych szukających Jego pomocy. Jezus uzdrawia tak wielu z nich, jak to tylko możliwe, ale przytłacza go ich ogromna liczba; w końcu poddaje się, krzycząc na nich, by zostawili Go w spokoju. Tej nocy Maryja pociesza Jezusa, gdy ten kładzie się spać („Wszystko w porządku”). Maryja kocha Jezusa, ale jest zdezorientowana, ponieważ jest on tak niepodobny do żadnego innego mężczyzny, którego spotkała („Nie wiem, jak go kochać”). Judasz idzie do kapłanów i wyraża swoje obawy, wraz z obawami o konsekwencje zdrady Jezusa („Damned for All Time”). Wykorzystując wątpliwości Judasza, kapłani oferują mu pieniądze za doprowadzenie ich do Jezusa. Judasz początkowo odmawia, ale Kajfasz i Annasz przekonują go, wskazując, że mógłby wykorzystać pieniądze na pomoc biednym. Judasz ujawnia, że Jezus będzie w Ogrodzie Getsemani w czwartek wieczorem („Blood Money”).
Podczas Ostatniej Wieczerzy (rozgrywającej się w ogrodzie na świeżym powietrzu w ciągu dnia), Jezus ujawnia, że wie, iż Piotr się Go wyprze… i że Judasz Go zdradzi. Między Jezusem a Judaszem dochodzi do gorzkiej kłótni, podczas której Judasz zarzuca Jezusowi, że (rzekomo) niszczy nadzieje i ideały, które sam im dał. Judasz grozi, że zrujnuje ambicje Jezusa, pozostając tam i nie pomagając Mu w osiągnięciu chwały. Jezus każe mu odejść – wskazując na to, że „Oni czekają na ciebie!” – co w końcu czyni („Jezus mówi, że „oni czekają na ciebie!”). — co w końcu czyni („Ostatnia wieczerza”). Gdy Apostołowie zasypiają, Jezus udaje się w głąb Getsemani, by modlić się o swoją rychłą śmierć; niechętnie zgadza się na realizację Bożego planu („Getsemani/ Chcę tylko powiedzieć”). Jezus czeka na Judasza, który rzeczywiście przybywa… w towarzystwie strażników. Zdradza Jezusa pocałunkiem. Uczniowie proponują walkę ze strażnikami, ale ustępują za namową Jezusa. Jezus zostaje zabrany do domu Kajfasza, uznany za winnego bluźnierstwa i wysłany do Piłata („Aresztowanie”). Piotr, w międzyczasie, jest oskarżony o bycie jednym z naśladowców Jezusa; bojąc się, on zaprzecza Jezusowi trzy razy („Zaprzeczenie Piotra”). Jezus zostaje zaprowadzony do rezydencji Piłata; namiestnik kpi z Niego, nie wiedząc, że Jezus jest człowiekiem z jego snu. Ponieważ nie ma do czynienia z Żydami, Piłat wysyła Jezusa do króla Heroda („Piłat i Chrystus”). Krzykliwy Herod cieszy się, że wreszcie spotka Jezusa, bo jest to szansa na potwierdzenie szumu, który krążył wokół niego. Herod namawia Jezusa, by dokonał różnych cudów, a kiedy tego nie robi, odrzuca Go jako nieszkodliwego fikusa. Każe strażnikom odesłać Jezusa do Piłata („King Herod’s Song/Try It And See”).
Maryja i Apostołowie przypominają sobie, jak wszystko się zaczęło i żałują, że ich sytuacja nie wymknęła się tak spod kontroli („Could We Start Again Please?”). Jezus zostaje wtrącony do celi; tam widzi go Judasz, który teraz żałuje swojej roli w aresztowaniu. Judasz rzuca swoje pieniądze na ziemię i przeklina kapłanów, po czym ucieka na pustynię. Ogarnięty smutkiem i żalem za zdradzenie Jezusa, Judasz obwinia Boga za swoje nieszczęścia, dając mu rolę zdrajcy. Podczas gdy Judasz wiesza się („Śmierć Judasza”), Jezus zostaje zabrany z powrotem do Piłata, który przystępuje do przesłuchania Go; Herod jest również obecny, ale nie zawraca sobie głowy składaniem zeznań, z uwagi na swoją pogardę dla Jezusa. Kajfasz zeznaje w imieniu Heroda. Piłat, choć uważa, że Jezus jest oszukany, zdaje sobie sprawę, że nie popełnił on rzeczywistego przestępstwa. Ma Jezusa biczowanego; Herod jest radosny na początku, ale następnie zbuntowany, a ostatecznie przerażony. Zdumiona obojętność Piłata przeradza się w szał dezorientacji i złości… głównie na irracjonalną żądzę krwi tłumu, ale także na niewytłumaczalną rezygnację i odmowę obrony Jezusa. Piłat uświadamia sobie, że nie ma innego wyjścia, jak tylko kazać Jezusa rozstrzelać, bo w przeciwnym razie masy będą coraz bardziej agresywne („Proces przed Piłatem; Trzydzieści dziewięć batów”). Wściekły Piłat wydaje wyrok śmierci zgodnie z żądaniem kapłanów. Następnie Piłat robi wielkie przedstawienie, w którym umywa ręce od losu Jezusa. Wygląd Jezusa zmienia się, otwierają się niebiosa i na srebrnym krzyżu zjeżdża ubrany w biały kombinezon Judasz. Judasz ubolewa, że Jezus powinien był powrócić jako Mesjasz dzisiaj, w latach siedemdziesiątych; byłby bardziej popularny, a jego przesłanie łatwiejsze do rozpowszechnienia. Judasz zastanawia się również, co Jezus myśli o prorokach innych religii… i, ostatecznie, czy Jezus myśli, że jest tym, za kogo go uważają, co może oznaczać, że jest Synem Bożym („Superstar”). Pytania Judasza pozostają bez odpowiedzi. Jezus zostaje wysłany na śmierć („The Crucifixion”) wśród złowieszczej, atonalnej muzyki; wypowiada niektóre ze swoich ostatnich słów przed śmiercią.
Jak film się kończy, wykonawcy (teraz już bez kostiumów) wsiadają do swojego autobusu. Tylko Barry Dennen, Yvonne Elliman i Carl Anderson – którzy grali (odpowiednio) Piłata, Marię Magdalenę i Judasza – zauważają, że Ted Neeley, który grał Jezusa, wydaje się być nieobecny. Anderson chwyta się tylnego wejścia autobusu, gdy ten rusza i odjeżdża. W końcowym ujęciu, podobnym do tego z Ben Hura, pasterz i jego stado przemierzają wzgórze pod pustym już krzyżem („John Nineteen Forty-One”).