Założony w 1886 roku przez pastora Johna Andrew Parkera, wolnego człowieka, Kościół Baptystów Ebenezera w Atlancie, Georgia miał tylko 13 członków i żadnego budynku kościelnego po odejściu Parkera w 1894 roku i kiedy Alfred Daniel Williams został jego drugim pastorem. Potężne kazania Williamsa i jego silne zdolności przywódcze sprawiły, że do 1913 r. liczba wiernych wzrosła do 750 osób. Zainspirowany trwającym całe życie pragnieniem głoszenia Słowa Bożego i doświadczeniem nawrócenia, oddanie Williamsa pozwoliło mu zabezpieczyć działkę na rogu Auburn Avenue i Jackson Street w Atlancie i zebrać 25 000 dolarów na budynek, który zawierał audytorium i galerię mogące pomieścić 1250 osób. Kościół rozpoczął budowę nowego budynku w marcu 1914 roku. Po odejściu pastora Williamsa w 1931 roku, wielebny Martin Luther King, Sr., mąż Alberty, córki pastora Williamsa, przejął pałeczkę przywództwa w Ebenezer.
Pastor King prowadził kościół, podczas gdy jego żona, Alberta Williams King, kierowała posługą muzyczną. Ich syn, Martin, Jr., dorastał w tym pielęgnującym chrześcijańskim środowisku. Swoje pierwsze kazanie w kościele wygłosił w 1948 roku, kiedy miał 19 lat, a wkrótce potem został wyświęcony na ministra. Niektóre z najtrwalszych kazań dr Martina Luthera Kinga Jr zostały wygłoszone w Ebenezer, wśród nich ”Wymiary pełnego życia”, ”Czym jest człowiek?” i ”Kochaj swoich wrogów”.
Kiedy młodszy King ukończył studia doktoranckie na Boston (Massachusetts) University School of Theology w 1954 roku, przyjął posadę pastora w Dexter Avenue Baptist Church w Montgomery, Alabama. Członkowie Kościoła Baptystów Ebenezer licznie uczestniczyli w jego nabożeństwie instalacyjnym. Dołączył do swojego ojca w Ebenezer jako współ-pasterz i służył od 1960 do 1968 roku, kiedy to został zamordowany. Jego brat, A. D. Williams King, służył jako współ-pastor po zamachu. „Daddy” King, jak Rev. Martin Luther King, Sr., był znany, kontynuował w tym charakterze aż do jego odejścia w 1975 roku.
W 1980 roku, Martin Luther King, Jr, National Historic Site został ustanowiony. Strona składa się z kilku budynków znajdujących się wokół domu Kinga na Auburn Avenue w historycznej dzielnicy Atlanty Sweet Auburn. Wśród tych struktur, oryginalne Ebenezer Baptist Church gmachu figuruje wybitnie jako miejsce dziedzictwa i odgrywa ważną rolę w eksploracji życia i osiągnięć dr King. Obiekt położony jest na 35 akrach. Znajduje się tam centrum dla zwiedzających z muzeum amerykańskiego ruchu praw obywatelskich, które ilustruje drogę, jaką przebył dr Martin Luther King, Jr. Znajduje się tam również Międzynarodowy Ogród Różany Pokoju „Mam Marzenie” oraz pomnik ku czci Mohandasa K. Gandhiego. Międzynarodowy Szlak Sławy Praw Obywatelskich honoruje tych, których poświęcenie przyczyniło się do urzeczywistnienia równości dla wszystkich. Centrum jest centralnym punktem podczas obchodów Dnia Martina Luthera Kinga, Jr. i Miesiąca Czarnej Historii.
Dzisiaj Ebenezer Baptist, z kongregacją 6,000, nadal służy społeczności Atlanty z nowego obiektu w King Historic Site pod kierownictwem Wielebnego Dr. Raphael G. Warnock. Dr Warnock służył wcześniej jako pastor pomocniczy w Abyssinian Baptist Church w Nowym Jorku oraz jako starszy pastor w Douglas Memorial Community Church w Baltimore, Maryland. Jest on dopiero piątym pastorem prowadzącym kongregację Ebenezer i pełni tę funkcję od 2005 roku.