Margaret „Peggy” Shippen urodziła się jako córka Edwarda Shippena IV i Margaret Francis w Filadelfii w Pensylwanii w 1760 roku. Shippenowie należeli do najbardziej prominentnych rodzin Filadelfii, choć ich lojalność została podzielona wraz z nadejściem rewolucji amerykańskiej. Edward, prominentny filadelfijski kupiec i sędzia, miał umiarkowane sympatie torysów, ale pozostał neutralny, gdy wybuchła wojna, podczas gdy jej starsza siostra Elizabeth wyszła za pułkownika armii kontynentalnej.
Poglądy polityczne Peggy stały się oczywiste podczas brytyjskiej okupacji Filadelfii. Peggy poznała brytyjskiego oficera o nazwisku John Andre, którego szkic młodej damy daje wgląd w jej życie i osobowość. Peggy miała spiskować z Andre w czasie zdrady jej męża, Benedicta Arnolda, w późniejszym okresie wojny. Chociaż spekuluje się, że Peggy miała romans z Andre podczas brytyjskiej okupacji Filadelfii, istnieje niewiele dowodów na poparcie tej tezy, poza szkicem, który Andre wykonał dla Peggy. Niezależnie od tego, obie utrzymywały korespondencję po opuszczeniu Filadelfii przez Brytyjczyków.
8 kwietnia 1779 r. Peggy poślubiła Arnolda, w wieku dziewiętnastu lat. Niedługo potem Arnold podjął fatalną decyzję o przejściu na stronę Brytyjczyków. Choć nie jest jasne, czy to ona podżegała go do tej decyzji, Peggy była współwinna zdrady Arnolda i być może to ona przedstawiła swojego męża Andre. Peggy pozostała w Filadelfii, gdzie była w stanie przekazywać informacje z listów męża poprzez łańcuch komunikacji i zakodowanych listów, który kończył się na Johnie Andre.
Podczas kulminacyjnego epizodu, w którym klęska Arnolda została ujawniona Armii Kontynentalnej, Peggy udawała histerię, aby odsunąć podejrzenia o jej udział w spisku, jednocześnie pomagając opóźnić schwytanie Arnolda przez siły Patriotów i ucieczkę Armii Kontynentalnej. Shippen dołączyła do niego w trzymanym przez Brytyjczyków Nowym Jorku, po tym jak rada miejska Filadelfii ją wygnała.
Po kapitulacji Brytyjczyków pod Yorktown, Arnoldowie przenieśli się do Londynu, którego wysokie sfery przyjęły Peggy z otwartymi ramionami. Królowa Charlotte przyznała jej roczną rentę w wysokości 100 funtów na opiekę nad dziećmi, a sam król Jerzy wręczył jej prezent w wysokości 350 funtów za jej zasługi. Z drugiej strony jej rodzinne miasto nie darzyło jej taką sympatią, mimo ciągłych wpływów ojca. Kiedy w 1791 roku po raz ostatni odwiedziła swoją rodzinę, spotkała się z bardzo chłodnym przyjęciem, a nawet z protestami, aż do wyjazdu. W międzyczasie Benedykt nieustannie starał się zbudować swoją fortunę w Londynie lub Nowym Brunszwiku w Kanadzie, ale bezskutecznie – w chwili śmierci zostawił jej jedynie zbiór długów. Sama Peggy odeszła w 1804 roku i została pochowana w kościele St. Mary’s Church w Battersea.