Papaína, enzima presente nas folhas, látex, raízes e frutos da papaieira (Carica papaya) que catalisa a decomposição das proteínas por hidrólise (adição de uma molécula de água).
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Papaína é utilizada na investigação bioquímica envolvendo a análise de proteínas, em amaciar carne, em clarificar cerveja, em remover pêlos das peles antes do bronzeamento, e em agentes de limpeza de acção enzimática para lentes de contacto macias. É também utilizada em pastas de dentes e cosméticos e em preparações de vários remédios para indigestão, úlceras, febre, e inchaço. Uma enzima relacionada também produzida pela papaia é a quimopapaína, que tem diferentes características de mobilidade e solubilidade; é utilizada para encolher ou dissolver discos rompidos em certos tipos de lesões da coluna lombar, e de outra forma como digestor de proteínas.
A quantidade e actividade da papaia isolada das diferentes partes da planta da papaia varia dependendo da idade da árvore e se é macho ou fêmea. Por exemplo, quantidades mais elevadas de papaína bruta podem ser extraídas de árvores fêmeas em comparação com árvores machos e de frutos mais velhos em comparação com frutos mais novos. Contudo, a papaína extraída de frutos jovens da papaieira produzida por árvores femininas é tipicamente mais activa do que a extraída de frutos velhos produzidos por plantas masculinas ou hermafroditas.
A papaína pode desencadear reacções alérgicas em indivíduos susceptíveis. Podem ocorrer reacções cutâneas após contacto com látex fresco da papaia; as reacções de hipersensibilidade podem ser especialmente pronunciadas em pessoas alérgicas ao látex.