Streptococcus pneumoniae. A menudo denominadas «neumococos», estas bacterias están normalmente presentes en la nariz y la faringe de muchas personas sin causar ninguna infección. Por lo tanto, son los portadores sanos de la población los que transmiten la bacteria a los ancianos, los niños u otras personas susceptibles, entre los que puede producirse una enfermedad grave. En Suiza, los neumococos causan alrededor de mil infecciones graves (en el torrente sanguíneo o como meningitis) cada año, así como varios miles de casos de neumonía. Estas bacterias también son responsables de muchas infecciones que se resuelven solas, como la bronquitis y las infecciones de oído.
El Staphylococcus aureus está presente como parte de la flora de la piel en alrededor de un tercio de la población humana, sin causar enfermedades. Dependiendo de la cepa y del sistema inmunitario de la persona infectada, el S. aureus puede infectar la piel, los huesos y los tejidos blandos del interior del cuerpo, incluido el torrente sanguíneo. En los hospitales, es la causa más frecuente de infecciones posquirúrgicas. En la ganadería, puede desencadenar diversas infecciones, especialmente en las ubres de las vacas lecheras (mastitis).
Escherichia coli es una enterobacteria que vive en los intestinos de los seres humanos y los animales sin causar enfermedades. Incluso es útil y forma parte de la flora intestinal normal de los individuos sanos. Pero puede causar infecciones si va a otro lugar del cuerpo, como el tracto urinario inferior, el abdomen o el cerebro en el caso de los recién nacidos. Se sabe que algunas cepas patógenas de E. coli (por ejemplo, la que produce la toxina O157:H7) pasan de los animales a los humanos a través de los productos alimenticios. En los seres humanos, estas bacterias pueden provocar fiebre, náuseas, vómitos, calambres estomacales y diarrea, que pueden ser mortales en algunos casos.
Klebsiella pneumoniae es otra especie de enterobacteria comúnmente presente en el tracto digestivo de humanos y animales sanos. Sin embargo, es una de las culpables más comunes de causar infecciones asociadas a los hospitales, así como infecciones del tracto urinario y del tracto respiratorio, especialmente neumonía. En los recién nacidos, la Klebsiella pneumoniae puede infectar el torrente sanguíneo, lo que provoca un aumento de las tasas de mortalidad. Este tipo de bacteria también tiene la capacidad de adquirir fácilmente múltiples formas de resistencia a los antibióticos.
También hay que mencionar a Acinetobacter baumannii y Pseudomonas aeruginosa, que se encuentran entre los denominados patógenos hospitalarios, porque producen principalmente infecciones dentro de los hospitales y las residencias. La resistencia de estas dos especies bacterianas a los antibióticos de último recurso, como los carbapenems y las polimixinas, está aumentando, tanto a nivel nacional como mundial.