El propósito de este estudio fue investigar los efectos del ejercicio isocinético sobre la fuerza, el sentido de la posición articular y la funcionalidad en atletas recreativos con inestabilidad funcional del tobillo (FAI). Se evaluó la fuerza, la propiocepción y el equilibrio de 24 atletas recreativos con FAI unilateral mediante la medición de la fuerza muscular isocinética, el sentido de la posición articular del tobillo y la prueba de bipedestación a una pierna. La capacidad funcional se evaluó mediante cinco pruebas diferentes. Éstas fueron: curso de salto con una sola extremidad (SLHC), salto con una y tres piernas para la distancia (OLHD-TLHD), y salto de seis y seis metros para el tiempo (SMHT-CSMHT). Se evaluó el par máximo isocinético de los músculos inversor y evertor del tobillo de forma excéntrica y concéntrica a velocidades de prueba de 120 grados /s. El protocolo de ejercicio isocinético se llevó a cabo a una velocidad angular de 120 grados /s. La sesión de ejercicio se repitió tres veces por semana y duró 6 semanas. Al inicio, se encontró que la fuerza concéntrica de los inversores era significativamente menor en los tobillos funcionalmente inestables en comparación con los tobillos sanos opuestos (p < 0,001). Esta diferencia no se presentó después de ejecutar las sesiones de ejercicio de 6 semanas (p > 0,05). El sentido de la posición de la articulación del tobillo en los tobillos lesionados disminuyó significativamente de 2,35 +/- 1,16 a 1,33 +/- 0,62 grados para 10 grados de ángulo de inversión (p < 0,001) y de 3,10 +/- 2,16 a 2,19 +/- 0,98 grados para 20 grados de ángulo de inversión (p < 0,05) tras el ejercicio isocinético. La puntuación de la prueba de bipedestación en una pierna disminuyó significativamente de 15,17 +/- 8,50 a 11,79 +/- 7,81 en los tobillos lesionados (p < 0,001). Tras el protocolo de ejercicio isocinético, todas las puntuaciones de las pruebas funcionales empeoradas en los tobillos lesionados en comparación con los tobillos sanos opuestos mostraron una mejora significativa (p < 0,01 para OLHD y CSMHT, p < 0,001 para SLHC, TLHD y SMHT). Estos resultados corroboran los déficits de fuerza, propiocepción, equilibrio y funcionalidad en atletas recreativos con FAI. El programa de ejercicios isocinéticos utilizado en este estudio tuvo un efecto positivo sobre estos parámetros.