Margaret «Peggy» Shippen fue hija de Edward Shippen IV y Margaret Francis en Filadelfia, Pensilvania, en 1760. Los Shippen eran una de las familias más prominentes de Filadelfia, aunque sus lealtades se dividieron con la llegada de la Revolución Americana. Edward, un prominente comerciante y juez de Filadelfia, tenía simpatías tory moderadas pero se mantuvo exteriormente neutral cuando estalló la guerra, mientras que su hermana mayor Elizabeth se casó con un coronel del Ejército Continental.
Las propias opiniones políticas de Peggy se hicieron evidentes durante la ocupación británica de Filadelfia. Peggy conoció a un oficial británico llamado John Andre, cuyo boceto de la joven ofrece una visión de su vida y personalidad. Peggy acabaría conspirando con Andre en el momento de la traición de su marido, Benedict Arnold, más adelante en la guerra. Aunque se ha especulado con la posibilidad de que Peggy mantuviera un romance con Andre durante la ocupación británica de Filadelfia, existen pocas pruebas que apoyen esta afirmación, aparte de un boceto que Andre hizo de Peggy. En cualquier caso, ambos mantuvieron una correspondencia después de que los británicos abandonaran Filadelfia.
El 8 de abril de 1779, Peggy se casó con Arnold, a la edad de diecinueve años. Poco después, Arnold tomó la fatídica decisión de desertar a los británicos. Aunque no está claro si ella instigó su deserción, Peggy fue cómplice de la ejecución de la traición de Arnold y puede haber sido la que presentó a su marido a André. Peggy había permanecido en Filadelfia, donde pudo pasar la información de las cartas de su marido a través de una cadena de comunicación y cartas codificadas que terminaban en John Andre.
Durante el episodio culminante en el que se reveló la deserción de Arnold al Ejército Continental, Peggy fingió histeria para evitar las sospechas sobre su participación en la conspiración, al tiempo que ayudaba a retrasar la captura de Arnold por las fuerzas patriotas y a huir del Ejército Continental. Shippen se unió a él en la ciudad de Nueva York, en manos de los británicos, después de que el ayuntamiento de Filadelfia la desterrara.
Después de la rendición británica en Yorktown, los Arnold se trasladaron a Londres, cuya alta sociedad recibió a Peggy con los brazos abiertos. La reina Carlota le concedió una pensión anual de 100 libras para que cuidara de sus hijos, y el propio rey Jorge le hizo un regalo de 350 libras por sus servicios. Su ciudad natal, en cambio, no sentía tanto cariño por ella, a pesar de la continua influencia de su padre. Recibió un recibimiento terriblemente frío cuando visitó a su familia por última vez en 1791, e incluso se enfrentó a algunas protestas hasta que se marchó. Mientras tanto, Benedict se esforzaba continuamente por construir su fortuna en Londres o en Nuevo Brunswick, en Canadá, en vano; al morir sólo le dejó una colección de deudas. La propia Peggy falleció en 1804, y fue enterrada en la iglesia de Santa María en Battersea.