Massaspectrometrie (MS) is een analysetype dat wordt gebruikt om te bepalen uit welke moleculen een monster is opgebouwd, op basis van het massaspectrum dat door de ionen wordt gecreëerd. Massaspectrometers kunnen de traditionele identificatie en kwantificering van doelanalyten uitvoeren; zij kunnen echter ook in een klinische omgeving worden gebruikt voor de snelle identificatie van bacteriën. De veroorzaker van sepsis verandert in de loop van de tijd, en klinische beslissingen over het beheer van infecties zijn vaak gebaseerd op de resultaten van bacteriële identificatie. Daarom is het van essentieel belang dat dergelijke identificaties snel worden uitgevoerd en correct worden geïnterpreteerd. De MALDI-TOF (Matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight) massaspectrometer is een van de meest populaire MS-instrumenten die in de biologie worden gebruikt, vanwege de snelle en nauwkeurige identificatie van genus en species van een uitgebreide reeks Gram-negatieve en -positieve bacteriën. De identificatie van micro-organismen met behulp van massaspectrometrie is gebaseerd op de identificatie van een karakteristiek spectrum van elke soort en wordt vervolgens gematcht met een grote database binnen het instrument. Dit overzicht geeft een hedendaags perspectief op de uitdagingen en mogelijkheden voor bacteriële identificatie, alsook een geschreven verslag van hoe technologische innovatie MS vooruit heeft geholpen. Ook toekomstige klinische toepassingen komen aan bod, met name het gebruik van MALDI-TOF MS op het gebied van de microbiologie voor de identificatie en de analyse van antibioticaresistentie.